El sistema de disputa será el mismo que años anteriores, dos ruedas de once fechas cada una, con partidos de ida y vuelta, todos contra todos.
Los equipos que regresarán a Primera División son Deportivo Recoleta y Atlético Tembetary, ambos con pasado en la máxima categoría del fútbol paraguayo.
El equipo canario retornará tras 23 años. Su última participación fue en el 2002, mientras que el Rojiverde lo hará tras 28 años, en donde llegó hasta la Primera C, última categoría del fútbol de la APF. Promedios: Recoleta y Tembetary arrancarán con promedio 0, por lo que deberán hacer una buena campaña para defender su estadía en Primera y no caer nuevamente a la Intermedia a final de la temporada 2025.
Por encima estará General Caballero de JLM con un promedio de 1,090, luego estará Trinidense (1,261), Sportivo Luqueño (1,272) y Sportivo Ameliano (1,284). Solamente el 2 de Mayo tendrá divisor menor (dos temporadas), el resto de los equipos, exceptuando los ascendidos, dividirán por tres.
